Бинокулярные оптические микроскопы аналогичны монокулярным, но имеют два окуляра, поэтому смотреть в микроскоп можно сразу двумя глазами. Нагрузка на глаза снижается, а исследователь не испытывает дискомфорт. В тех лабораториях, где за микроскопом приходится проводить значительное количество времени, чаще всего можно увидеть бинокулярный микроскоп.